معرفی نشانگرهای ژنتیکی و اهمیت آنها
در گذشته ارزیابی ذخائر، تشخیص گونهها و جمعیتها با استفاده از صفات مورفومتریک و مریستیک صورت میگرفت اما با توجه به حساسیت بالای این صفات و اثرات منفی دستکاری در نشانه گذاری بر سلامت ماهیان و همچنین محدود بودن تفسیر داده های نشانه گذاری به زمان جمع آوری آنها، علم استفاده از نشانگرهای مولکولی همچون میکروستلایت،RAPD،RFLP،AFLP و Allozym جهت شناسایی ساختار ژنتیکی ذخائر توسعه یافت. این نشانگرها به طور گسترده ای در بسیاری زمینهها از قبیل نقشه یابی و ردیابی ژنها، تعیین جنسیت، بررسی تنوع ژنتیکی یا روابط ژنتیکی به کار میروند(Adams و Hutchings،2003). روشهای مبتنی بر DNA امروزه بهترین روشهایی هستند که برای تمایز بین موجودات بسیار نزدیک به هم انتخاب میشوند. یک نشانگر مولکولی مناسب باید خصوصیاتی از قبیل : توارث مندلی، پلی مورفیک بودن، هم بارزی، خنثی بودن، مستقل بودن از محیط، نداشتن اپیستازی و تکرار پذیری بالا در طول ژنوم را دارا باشد. AFLP (Amplified Fragment length polymorphism) نشانگر جدیدی است که تمام ویژگیهای یک نشانگر مولکولی مناسب، غیر از همبارز بودن را دارا میباشد؛ اما به علت پلی مورفیسم بالای که تشخیص میدهد، خصوصا در مواقعی که روابط نزدیکی وجود دارد، کارآمدترین نشانگرها میباشد (Boninو همکاران،2005). این نشانگر مبتنی بر واکنش زنجیره ای پلیمراز بوده و تلفیقی از روشهای RFLP و RADP میباشد که بر مشکلات آنها فائق آمده است (Liu و Cordes،2004). در مقایسه با RFLP که فقط جایگاه برش جهت تفاوت در توالی DNA استفاده میشود؛ نوکلئوتید انتخابی در انتخابی در AFLP، امکان شناسایی پلی مورفیسم پشت جایگاه برش را فراهم میکند. همچنین این روش ظرفیت شناسایی جهشهای نقطه ای بیشتری را نسبت به RFLP داراست(Vosو همکاران،1995). در روش RAPD ، به دلیل حساسیت بالای این نشانگر به مسائلی از قبیل: شرایط واکنش، غلظت DNA الگو و خلوص آن و پروفیل دمایی PCR، کاربرد آن محدود شده است.AFLP در شرایط اتصال(Annaeling) شدیدتر که قابلیت تکثیر بهتر را تضمین میکند، انجام میشود(Folkertsma، 1996). قابلیت اعتماد بالای نشانگر AFLP میتواند منجر به جایگزین شدن آن با نشانگر RAPD شود.همچنین در مطالعه مقایسه ای که توسط Campbell و همکاران(2003) بین روش AFLP و میکروستلایت، انجام شد، بیان شد که AFLP ممکن است در مطالعات ارزیابی جمعیتی به خصوص زمانی که تفاوت جمعیتها اندک بوده و در مقیاسهای بزرگ به دلیل نشان دادن تعداد اوکوس های زیاد، نسبت به میکروستلایت ارجحتر است(Muller و Wolfenbarger،1999) و قطعات با ارزشی را برای موجوداتی که نشانگرهای میکروساتلایت آنها مشکل به دست میآید، فراهم میکند (Bonin و همکاران،2005). سهولت استفاده از این نشانگر ممکن است منجر به جایگزین شدن آن با نشانگرهای خوب دیگری چون RFLP و میکروستلایت حداقل در پاره ای مسائل از قبیل QTL و تفاوت جمعیتی شود (Muller و Wolfenbarger،1999) شود.
سعی میکنم در این وبلاگ مطالب مطالبی قرار بدم که جای دیگه به سختی بدست میارین. و اگر مطلبی خواستین که در وبلاگ نبود در قسمت نظرات بیان کنین با گفتن نظرات خود هم به ما در بهتر شدن وبلاگ کمک کنین و هرچه انتظارات شما بیشتر باشه به اجبار کیفیت ما هم بالا خواهد رفت. پس نظر یادتون نره.